開放閱讀框查找器可以在目標(biāo)DNA序列中搜尋開放閱讀框。此工具可以輸出每個ORF所在的區(qū)域,并翻譯成對應(yīng)的蛋白序列。此工具可以為新測序的DNA序列查找潛在的蛋白編碼區(qū)。此工具支持IUPAC或多種密碼子。
輸入FASTA格式的序列,最大長度限制在100000以內(nèi)。
* 開放閱讀框開始于: 任何密碼子 atg atg, gtg, ctg, ttg 。
* 查找ORF需要從閱讀框 1 2 3 1, 2, and 3 搜索 正 反 鏈。
* 只展示密碼子個數(shù)大于 的片段。
* 使用 standard (1) vertebrate mitochondrial (2) yeast mitochondrial (3) mold mitochondrial (4) invertebrate mitochondrial (5) ciliate nuclear (6) echinoderm mitochondrial (9) euplotid nuclear (10) bacterial (11) alternative yeast nuclear (12) ascidian mitochondrial (13) flatworm mitochondrial (14) Blepharisma macronuclear (15) chlorophycean mitochondrial (16) trematode mitochondrial (21) Scenedesmus obliquus mitochondrial (22) Thraustochytrium mitochondrial (23) 密碼子表.
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